Date
| Sommario | Programma | Workshop


Organizzatori
Mario R. Guarracino
Roberto Vaccaro
Lorenzo Verdoscia
Isituto di Calcolo e Reti ad Alte Prestazioni
ICAR-CNR

Scarica la locandina | Modulo d'iscrizione
   Date   
Il tutorial si terrà martedì 18 dicembre 2007.
La partecipazione è gratuita per gli iscritti. Per garantire a tutti i partecipanti la migliore accoglienza e per motivi organizzativi e tecnici, preghiamo di confermare la presenza entro il
10 Dicembre 2007
utilizzando il modulo di iscrizione.
  Sommario  

L'analisi dei dati di espressione genica prodotti da microarray rappresenta uno dei problemi di maggiore rilievo nell'ambito della biologia computazionale. La complessità dei dati e il numero elevato di metodi e strumenti di analisi disponibili rappresenta una barriera invalicabile per il ricercatore che vuole comprendere appieno il risultato dei propri esperimenti.

Scopo del tutorial è fornire sia una panoramica dei metodi e algoritmi per l'analisi dei dati di microarray, sia i rudimenti per il corretto utilizzo degli strumenti.

Il corso è rivolto a dottorandi e ricercatori:

  • biologi e medici che vogliono utilizzare al meglio gli strumenti a disposizione,
  • matematici, statistici e informatici che vogliono capire come gli algoritmi e i metodi di loro competenza trovano applicazione nelle scienze della vita.
  Programma  

9.00 - 9.30 Introduzione

9.30 - 10.10 Identificazione di pathways molecolari associati alla resistenza all'imatinib nella leucemia mieloide cronica mediante la tecnologia del microarray. Dal design all'analisi dei dati. Rosanna Martinelli - CEINGE

10.10 - 10.50 Piattaforme "omics" per organismi di interesse agrario. Marilù Chiusano Università di Napoli

10.50 - 11.20 Pausa

11.20 - 12.00 Metodi per l'analisi di immagini di microarray. Lucia Maddalena ICAR - CNR

12.00 - 12.40 Valutazione di software di analisi di microarray basato su simulazioni di immagini da dati reali. Ignazio Infantino ICAR - CNR

12.40 - 13.20 Analisi di serie temporali per microarray. Claudia Angelini IAC - CNR

13.20 - 14.10 Pausa

14.10 - 14.50 Applicazioni web per la gestione di dati di esperimenti da microarray: un caso di studio. Antonio d'Acierno ISA - CNR

14.50 - 15.30 Microarray data Analysis: Clustering and Validation Measures - Parte I. Raffaele Giancarlo Università di Palermo

15.30 - 16.10 Microarray data Analysis: Clustering and Validation Measures - Parte II. Raffaele Giancarlo Università di Palermo

16.10 - 16.50 Tecniche di classificazione per microarray. Mario Guarracino ICAR - CNR

16.50 - 17.30 Discussione